you are absolutly right! Thank you very much!<br><br>
<div><span class="gmail_quote">2008/3/30, Justin A. Lemkul &lt;<a href="mailto:jalemkul@vt.edu">jalemkul@vt.edu</a>&gt;:</span>
<blockquote class="gmail_quote" style="PADDING-LEFT: 1ex; MARGIN: 0px 0px 0px 0.8ex; BORDER-LEFT: #ccc 1px solid">Quoting shuai lu &lt;<a href="mailto:luai.cpu@gmail.com">luai.cpu@gmail.com</a>&gt;:<br><br>&gt; Hello,<br>
&gt;<br>&gt; When I processed the mdrun by &quot; mpirun -np 4 mdrun -deffnm md -N 4 &amp;&quot;, there<br>&gt; was an error, saying &quot;run input file md.tpr was made for 1 nodes,<br>&gt; while mdrun expected it to be for 4 nodes&quot;. Is there anybody who know what<br>
&gt; it means? How should I avoid it, to chang the *.mdp file?<br>&gt; Thank you!<br><br>Use grompp -np 4.&nbsp;&nbsp;mdrun -h would have told you this, under the information<br>about the -np flag.<br><br>-Justin<br><br>&gt;<br>&gt; --<br>
&gt; Lu Shuai<br>&gt; China Pharmaceutical University<br>&gt;<br><br><br><br>========================================<br><br>Justin A. Lemkul<br>Graduate Research Assistant<br>Department of Biochemistry<br>Virginia Tech<br>
Blacksburg, VA<br><a href="mailto:jalemkul@vt.edu">jalemkul@vt.edu</a> | (540) 231-9080<br><a href="http://www.bevanlab.biochem.vt.edu/Pages/Personal/justin/">http://www.bevanlab.biochem.vt.edu/Pages/Personal/justin/</a><br>
<br>========================================<br>_______________________________________________<br>gmx-users mailing list&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;<a href="mailto:gmx-users@gromacs.org">gmx-users@gromacs.org</a><br><a href="http://www.gromacs.org/mailman/listinfo/gmx-users">http://www.gromacs.org/mailman/listinfo/gmx-users</a><br>
Please search the archive at <a href="http://www.gromacs.org/search">http://www.gromacs.org/search</a> before posting!<br>Please don&#39;t post (un)subscribe requests to the list. Use the<br>www interface or send it to <a href="mailto:gmx-users-request@gromacs.org">gmx-users-request@gromacs.org</a>.<br>
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