<html>
<head>
<style>
.hmmessage P
{
margin:0px;
padding:0px
}
body.hmmessage
{
FONT-SIZE: 10pt;
FONT-FAMILY:Tahoma
}
</style>
</head>
<body class='hmmessage'><div style="text-align: left;">Hi,<br><br>Gromacs 4 has blue gene optimized inner loops, which give a factor of 2<br>performance improvement.<br>On a BG/L it runs at 20-25% of the speed of x86 cores, but it scales<br>quite well.<br><br>Berk.<br><br></div><br><hr id="stopSpelling">&gt; Date: Mon, 31 Mar 2008 17:29:57 -0700<br>&gt; From: tieleman@ucalgary.ca<br>&gt; To: gmx-users@gromacs.org<br>&gt; Subject: Re: [gmx-users] Blue Gene/P<br>&gt; <br>&gt; Thanks. I've seen the BG/L argument, but BG/P processors are faster. I <br>&gt; have no idea how much though, and am looking for actual numbers or if <br>&gt; those are not available a guess based on actual BG/L numbers and some <br>&gt; argument about scaling to a BG/P.<br>&gt;  <br>&gt; Cheers,<br>&gt; Peter<br>&gt; <br>&gt; Mark Abraham wrote:<br>&gt; &gt; Peter Tieleman wrote:<br>&gt; &gt;&gt; Hi,<br>&gt; &gt;&gt;<br>&gt; &gt;&gt; Has anyone run benchmarks on a BlueGene/P ?<br>&gt; &gt;<br>&gt; &gt; The word from IBM in December was that since GROMACS 3.x would lack <br>&gt; &gt; both assembly inner-loops and threading on BlueGene/L, that it wasn't <br>&gt; &gt; worthwhile running GROMACS on onw. I figure that goes for BlueGene/P too.<br>&gt; &gt;<br>&gt; &gt; Mark<br>&gt; &gt; _______________________________________________<br>&gt; &gt; gmx-users mailing list    gmx-users@gromacs.org<br>&gt; &gt; http://www.gromacs.org/mailman/listinfo/gmx-users<br>&gt; &gt; Please search the archive at http://www.gromacs.org/search before <br>&gt; &gt; posting!<br>&gt; &gt; Please don't post (un)subscribe requests to the list. Use the www <br>&gt; &gt; interface or send it to gmx-users-request@gromacs.org.<br>&gt; &gt; Can't post? Read http://www.gromacs.org/mailing_lists/users.php<br>&gt; &gt;<br>&gt; &gt;<br>&gt; <br>&gt; _______________________________________________<br>&gt; gmx-users mailing list    gmx-users@gromacs.org<br>&gt; http://www.gromacs.org/mailman/listinfo/gmx-users<br>&gt; Please search the archive at http://www.gromacs.org/search before posting!<br>&gt; Please don't post (un)subscribe requests to the list. Use the <br>&gt; www interface or send it to gmx-users-request@gromacs.org.<br>&gt; Can't post? Read http://www.gromacs.org/mailing_lists/users.php<br><br /><hr />Express yourself instantly with MSN Messenger! <a href='http://clk.atdmt.com/AVE/go/onm00200471ave/direct/01/' target='_new'>MSN Messenger</a></body>
</html>