<div>you mah try to use VMD progam for trajectory analysis. In this program, you can visuluaze the change of bond angle through the simulation.</div>  <div>&nbsp;</div>  <div><BR><BR><B><I>Zuzana Benkova &lt;zuzana.benkova@student.kuleuven.be&gt;</I></B> schrieb:</div>  <BLOCKQUOTE class=replbq style="PADDING-LEFT: 5px; MARGIN-LEFT: 5px; BORDER-LEFT: #1010ff 2px solid">Dear GMX users,<BR>I want to analyse th ebond angle. I have used<BR><BR>mk_angndx -s md1.tpr -n angle.ndx<BR><BR>to prepare an index for g_angle.<BR><BR>After<BR>g_angle -f md1.xtc -s md1.tpr -n angle.ndx<BR><BR>I have obtained<BR><BR>Software inconsistency error:<BR>Not supported in get_stx_coordnum<BR>Most likely this is a trivial question and I did some stupid mistake <BR>but I would be thankful for help. Thank you in advance<BR>Zuzana<BR>_______________________________________________<BR>gmx-users mailing list gmx-users@gromacs.org<BR>http://www.gromacs.org/mailman/listinfo/gmx-users<BR>Please search the
 archive at http://www.gromacs.org/search before posting!<BR>Please don't post (un)subscribe requests to the list. Use the <BR>www interface or send it to gmx-users-request@gromacs.org.<BR>Can't post? Read http://www.gromacs.org/mailing_lists/users.php<BR></BLOCKQUOTE><BR><p>&#32;
      <hr size=1>
Gesendet von <a  
href="http://us.rd.yahoo.com/mailuk/taglines/isp/control/*http://us.rd.yahoo.com/evt=52427/*http://de.overview.mail.yahoo.com" target=_blank>Yahoo! Mail</a>.
<br>
Dem pfiffigeren Posteingang.