Dear David,<br><br>while ERROR for&nbsp; dec+water complex test is clear, I do not know what to make of this one:<br><br><br>FAILED. Check files in acetonitrilRF<br><br>from /gmxtest/complex/acetonitrilRF/md.log:<br><br>Initializing LINear Constraint Solver<br>
&nbsp; number of constraints is 526<br>&nbsp; average number of constraints coupled to one constraint is 0.0<br><br>&nbsp;&nbsp; Rel. Constraint Deviation:&nbsp; Max&nbsp;&nbsp;&nbsp; between atoms&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; RMS<br>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; Before LINCS&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.004201&nbsp;&nbsp;&nbsp; 766&nbsp;&nbsp;&nbsp; 767&nbsp;&nbsp; 0.001573<br>
&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; After LINCS&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.000001&nbsp;&nbsp;&nbsp; 481&nbsp;&nbsp;&nbsp; 482&nbsp;&nbsp; 0.000000<br><br><br>Constraining the coordinates at t0-dt (step -1)<br>&nbsp;&nbsp; Rel. Constraint Deviation:&nbsp; Max&nbsp;&nbsp;&nbsp; between atoms&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; RMS<br>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; Before LINCS&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.000121&nbsp;&nbsp;&nbsp; 796&nbsp;&nbsp;&nbsp; 797&nbsp;&nbsp; 0.000045<br>
&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; After LINCS&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.000001&nbsp;&nbsp;&nbsp; 685&nbsp;&nbsp;&nbsp; 686&nbsp;&nbsp; 0.000000<br><br>Started mdrun on node 0 Thu Apr&nbsp; 3 14:52:16 2008<br>Initial temperature: 326.674 K<br>Configuring nonbonded kernels...<br>Testing AMD 3DNow support... not present.<br>
Testing ia32 SSE support... present.<br><br><br><br>-------------------------------------------------------<br>Program mdrun, VERSION 3.3.2<br>Source code file: network.c, line: 437<br><br>Routine should not have been called:<br>
gmx_sumi<br>-------------------------------------------------------<br><br>Please advise, thank you!<br>Nadia<br><br>