<html>
<head>
<style>
.hmmessage P
{
margin:0px;
padding:0px
}
body.hmmessage
{
FONT-SIZE: 10pt;
FONT-FAMILY:Tahoma
}
</style>
</head>
<body class='hmmessage'>
Hi Zuzana,<BR>
&nbsp;<BR>
what version are you running? I had the same problem.&nbsp;<BR>
After couple of sleepless nights&nbsp;found in archives that there was a bug in version 3.3.2:-)<BR>
When I followed the advice given there<BR>
&nbsp;<BR>
<EM>This is a known bug, recently introduced, but fixed again in CVS. You <BR>can edit the source code of src/tools/gmx_angle.c on line 376 (see <BR>below) you have to replace TPX by TPS (as is done already here).<BR><BR>read_ang_dih(ftp2fn(efTRX,NFILE,fnm),ftp2fn(efTPS,NFILE,fnm),(mult == 3),<BR>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; bALL || bCorr || bTrans || opt2bSet("-or",NFILE,fnm),<BR>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; bRb,bPBC,maxangstat,angstat,<BR>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; &amp;nframes,&amp;time,isize,index,&amp;trans_frac,&amp;aver_angle,dih);</EM><BR>
<BR>it worked fine. Or may be consider upgrading direcly to version 3.3.3.<BR>
&nbsp;<BR>
Best regards,<BR>
&nbsp;<BR>
Katka Hynstova<BR>
&nbsp;<BR>
&nbsp;<BR>
&nbsp;<BR>
&gt; Dear GMX users,<BR>&gt; I want to analyse th ebond angle. I have used<BR>&gt; <BR>&gt; mk_angndx -s md1.tpr -n angle.ndx<BR>&gt; <BR>&gt; to prepare an index for g_angle.<BR>&gt; <BR>&gt; After<BR>&gt; g_angle -f md1.xtc -s md1.tpr -n angle.ndx<BR>&gt; <BR>&gt; I have obtained<BR>&gt; <BR>&gt; Software inconsistency error:<BR>&gt; Not supported in get_stx_coordnum<BR>&gt; Most likely this is a trivial question and I did some stupid mistake<BR>&gt; but I would be thankful for help. Thank you in advance<BR>&gt; Zuzana<BR><BR><br /><hr />Explore the seven wonders of the world <a href='http://search.msn.com/results.aspx?q=7+wonders+world&mkt=en-US&form=QBRE' target='_new'>Learn more!</a></body>
</html>