
<!DOCTYPE HTML PUBLIC "-//W3C//DTD HTML 4.0 TRANSITIONAL//EN">

<HTML>

<HEAD>

  <META HTTP-EQUIV="Content-Type" CONTENT="text/html; CHARSET=UTF-8">

  <META NAME="GENERATOR" CONTENT="GtkHTML/3.16.1">

</HEAD>

<BODY>

Hi everyone.<BR>

<BR>

I'm interested in running a steered MD simulation of a protein + inhibitor complex with the aim of reproduce the large conformational changes that are experimentally demonstrated to occur during ligand binding. Can I be able to reproduce such big conformational changes through SMD simulations??<BR>

How to select the the direction in which to pull the ligand??<BR>

<BR>

Thanks in advance for any suggestion.<BR>

<BR>

Yunierkis<BR>

<BR>

</BODY>

</HTML>