<div>&nbsp;</div>
<div>Hello everyone,</div>
<div>&nbsp;</div>
<div>Here i want to caculate the binding free energy between an ligand and its receptor. Should I set free_energy as &quot;yes&quot; in Free Energy Perturbation Part </div>
<div>or use g_lie by doing&nbsp;&nbsp;recepto-ligand-solvate md&nbsp;and ligand-solvate md separately?</div>
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<div>If run a md by set free_energy as &quot;yes&quot;, how shoud i get free energy, just by g_energy alone or with some special parameter?</div>
<div>For anther method,&nbsp;can the energy calculated by &nbsp;g_lie programme be thought as binding free energy?</div>
<div>&nbsp;</div>
<div>Thank you!<br clear="all"><br>-- <br>Lu Shuai</div>