<P>
&nbsp; <BR>
Hi all,<BR>
it may be trivial question <BR>
My protien contain nearly 200 residues, I want plot RMSD for 45 to 90 residues , So I made make_ndx file also, but I am doubting that what i have I done whether right ot wrong? <BR>
I have selcted <BR>
1 | r 45-90 1 = protein , the way I have selected is correct or I have to select <BR>
3 | r 45-90 3 = C-alpha<BR>
Pls tell me<BR>
Thanks in advance<BR>

</P>
<br><br>
<Table border=0 Width=644 Height=57 cellspacing=0 cellpadding=0 style='font-family:Verdana;font-size:11px;line-height:15px;'><TR><td><a href='http://adworks.rediff.com/cgi-bin/AdWorks/click.cgi/www.rediff.com/signature-home.htm/1050715198@Middle5/2092210_2084731/2092364/1?PARTNER=3&OAS_QUERY=null' target=new ><img src ='http://imadworks.rediff.com/cgi-bin/AdWorks/adimage.cgi/2092210_2084731/creative_2092364.gif'  alt='IPL'  border=0></a></td></TR></Table>