<div>HI </div>
<div>Here is my pdb file.</div>
<div>When I typed </div>
<div>pdb2gmx -f xx.pdb -p xx.top -o xx.gro</div>
<div>&nbsp;</div>
<div>it showed input / output error.</div>
<div>Could anyone point out what the mistakes I made?</div>
<div>Thanks&nbsp;a lot</div>
<div>Lin</div>
<div>&nbsp;</div>
<div>&nbsp;</div>
<div>REMARK&nbsp; MOL&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; <br>ATOM&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 1&nbsp; C3&nbsp; MOL&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 1&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 3.747&nbsp;&nbsp; 1.679&nbsp;&nbsp; 1.116<br>ATOM&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 2&nbsp; H3&nbsp; MOL&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 1&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 4.400&nbsp;&nbsp; 1.022&nbsp;&nbsp; 1.684<br>ATOM&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 3&nbsp; C2&nbsp; MOL&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 1&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 2.378&nbsp;&nbsp; 1.705&nbsp;&nbsp; 1.382<br>
ATOM&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 4&nbsp; H2&nbsp; MOL&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 1&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 1.963&nbsp;&nbsp; 1.062&nbsp;&nbsp; 2.156<br>ATOM&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 5&nbsp; C1&nbsp; MOL&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 1&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 1.544&nbsp;&nbsp; 2.555&nbsp;&nbsp; 0.658<br>ATOM&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 6&nbsp; H1&nbsp; MOL&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 1&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.477&nbsp;&nbsp; 2.581&nbsp;&nbsp; 0.870<br>ATOM&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 7&nbsp; C6&nbsp; MOL&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 1&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 2.077&nbsp;&nbsp; 3.378&nbsp; -0.333<br>
ATOM&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 8&nbsp; H5&nbsp; MOL&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 1&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 1.430&nbsp;&nbsp; 4.052&nbsp; -0.892<br>ATOM&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 9&nbsp; C5&nbsp; MOL&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 1&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 3.444&nbsp;&nbsp; 3.339&nbsp; -0.608<br>ATOM&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 10&nbsp; H4&nbsp; MOL&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 1&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 3.865&nbsp;&nbsp; 3.979&nbsp; -1.378<br>ATOM&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 11&nbsp; C4&nbsp; MOL&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 1&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 4.281&nbsp;&nbsp; 2.486&nbsp;&nbsp; 0.110<br>
ATOM&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 12&nbsp; N1&nbsp; MOL&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 1&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 5.694&nbsp;&nbsp; 2.490&nbsp; -0.176<br>ATOM&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 13&nbsp; N2&nbsp; MOL&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 1&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 6.272&nbsp;&nbsp; 1.500&nbsp; -0.716<br>ATOM&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 14&nbsp; C7&nbsp; MOL&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 1&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 5.574&nbsp;&nbsp; 0.272&nbsp; -1.007<br>ATOM&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 15&nbsp; C8&nbsp; MOL&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 1&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 5.900&nbsp; -0.877&nbsp; -0.286<br>
ATOM&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 16&nbsp; H6&nbsp; MOL&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 1&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 6.660&nbsp; -0.825&nbsp;&nbsp; 0.489<br>ATOM&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 17&nbsp; C9&nbsp; MOL&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 1&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 5.261&nbsp; -2.085&nbsp; -0.563<br>ATOM&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 18&nbsp; H7&nbsp; MOL&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 1&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 5.524&nbsp; -2.980&nbsp; -0.003<br>ATOM&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 19&nbsp; C10 MOL&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 1&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 4.289&nbsp; -2.144&nbsp; -1.561<br>
ATOM&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 20&nbsp; H8&nbsp; MOL&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 1&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 3.786&nbsp; -3.084&nbsp; -1.776<br>ATOM&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 21&nbsp; C11 MOL&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 1&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 3.964&nbsp; -0.998&nbsp; -2.286<br>ATOM&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 22&nbsp; H9&nbsp; MOL&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 1&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 3.205&nbsp; -1.042&nbsp; -3.065<br>ATOM&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 23&nbsp; C12 MOL&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 1&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 4.615&nbsp;&nbsp; 0.205&nbsp; -2.018<br>
ATOM&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 24&nbsp; H10 MOL&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 1&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 4.368&nbsp;&nbsp; 1.098&nbsp; -2.587<br>TER&nbsp;&nbsp; <br>END&nbsp;&nbsp; <br></div>