I am trying to simulate the flow of nitrogen over a cylinder and would like to use gromacs.&nbsp; Most of the simulations seem to be done in water, but I was wondering how to go about creating the simulation in Nitrogen. I can create the cylinder. After that I want to try to create a shear flow by assigning a linear velocity profile to the Nitrogen. I realize this will probably have to be done in NEMD. Any thoughts or ideas would be appreciated.<br>
<br>Andy Shelley<br>