<br clear="all"><br>Dear Friends,<br>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; I extracted few conformation from my running job by using trjconv. but now as I want to minimize this conformation it is showing Fatal error that&nbsp; *.pdb&nbsp; and *.top coordinates does not match.<br>
<br>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; I gave this command for my minimization grompp -f em.mdp -c *.pdb -o em.tpr -p *.top<br>&nbsp;<br>&nbsp;&nbsp; Thanks<br>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; Anamika<br>