<DIV>Dear users,</DIV>
<DIV>As the Gromacs manual mentioned, "g_energy" cauld calculate the free energy difference with an ideal gas state. After a simulation of protein in water with GMX3.3.1, I have tried the following&nbsp; commands to compute deltaG.<BR>&nbsp;1.&nbsp; g_energy -f md.edr -fee -fetemp 300&nbsp; -o energy1.xvg<BR>2.&nbsp;&nbsp; g_energy -f md.edr&nbsp;&nbsp; -o energy2.xvg<BR>After the command line,&nbsp; I choose the item "potential". However, I have got&nbsp; idential xvg files with no info of deltaG.<BR>Could anyone tell how to carry out the deltaG computations?<BR>Many many thanks to you guys.</DIV>
<DIV>&nbsp;</DIV> <br><!-- urlfiles --><br><br><!-- footer --><br>