<P>
&nbsp; <BR>
HI users,<BR>
&nbsp; &nbsp; &nbsp;  I have embedded protein in popc bilayer and ran the minimisation succesfully , before going equilibration I would like to confirm one thing that how to run the equilibration with on which system keep position restrain?<BR>
<BR>
1.we will keep position restrain on all the systems(-DPOSRES_PROTEIN, -DPOSRES_LIPID, -DPOSRES_WATER) at a time ? <BR>
<BR>
or 2. keep position resrain on each system at a time and<BR>
&nbsp;  3.is it require to keep position restrain on water?<BR>
Could you tell me clearly pls<BR>
Thanks alot in advance
</P>
<br><br>
<Table border=0 Width=644 Height=57 cellspacing=0 cellpadding=0 style='font-family:Verdana;font-size:11px;line-height:15px;'><TR><td><a href='http://adworks.rediff.com/cgi-bin/AdWorks/click.cgi/www.rediff.com/signature-home.htm/1050715198@Middle5/2204104_2196511/2199118/1?PARTNER=3&OAS_QUERY=null' target=new ><img src ='http://imadworks.rediff.com/cgi-bin/AdWorks/adimage.cgi/2204104_2196511/creative_2199118.gif'  alt='HSBC'  border=0></a></td></TR></Table>