&nbsp;Hi,<br>&nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp;&nbsp; I want to find deuterium order parameter of the system of DPPC+SM+CHOL+WATER<br><br>
 &nbsp; &nbsp; g_order -f traj.trr -s topol.tpr -n index.ndx -dt 0.001<br>
 &nbsp; &nbsp;it gives the following error:<br><div id="1evr" class="ArwC7c ckChnd"><br>Taking z axis as normal to the membrane<br>Reading file topol.tpr, VERSION 3.3.3 (single precision)<br>Using following groups: <br>Groupname: System First atomname: C1 First atomnr 0<br>
Groupname: DPP First atomname: C1 First atomnr 0<br>Groupname: SM First atomname: C1 First atomnr 1000<br>Groupname: CHOL First atomname: C1 First atomnr 2000<br>Groupname: SOL First atomname: OW First atomnr 2580<br><br>
trn version: GMX_trn_file (single precision)<br>Reading frame&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0 time&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.000&nbsp;&nbsp; Number of elements in first group: 3180<br><br>-------------------------------------------------------<br>Program g_order, VERSION 3.3.3<br>
Source code file: gmx_order.c, line: 360<br><br>Fatal error:<br>grp 1 does not have same number of elements as grp 1<br><br>-------------------------------------------------------<br><br>
<br>
 &nbsp; &nbsp;How can I analyze the order parameter my system? Can you answer my question?<br>
 &nbsp; &nbsp;I don&#39;t understand what to do.<br>
 &nbsp; &nbsp;Regards,<br>
 &nbsp; &nbsp;Anirban<br>
</div>