Dear colleagues,<br><br>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; I successfully finished a 3 ns gromacs run using 40 nodes.&nbsp; When, I tried to convert .trr file to .xtc using trjconv, the run stops at 560 frame giving error "cannot determimine precision of trn file". I tried various options like -skip, -b and -e, -dt option as well as -ndx option . But, each time, the run stops at 560.&nbsp; <br>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; The second run I gave for 6 ns and this time, the trjconv stops at 1180 frame. I have observed the .trr files occupying huge memory space - 18 G for 3ns and 34 G for 6 ns runs respectively. Memory is not a problem, as I have lot of disk space available.<br>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; My system is a pentamer with 1052 residues and 47201 water molecules.The simulation ran for 5 days.<br><br>I would be extremely thankful for any kind of suggestions in this regard.<br><br>Prema,<br>Graduate student,<br>University of Houston.<br>