<div dir="ltr">Hi, <br>&nbsp;&nbsp;&nbsp; I would like to calculate B-factor of protein, so I performed command like this<br>g_rmsf&nbsp; -f&nbsp; .xtc&nbsp; -s&nbsp; .tpr&nbsp;&nbsp; -res&nbsp; -o&nbsp; fluctuate.xvg -od devi.xvg it has run without error.Now i am bit doubting that which .xvg file&nbsp; have to take for plot B-factor values?<br>
B-factor is nothing but thermal devation of atoms. I think, I should take dev.xvg for plotting B-factor values, if it is coorect, then what&#39; s the need for&nbsp; producing&nbsp; fluctuate.xvg? may be this is trivial question.<br>
Could anyone help me pls.<br>Thanks alot in advance<br></div>