<!DOCTYPE html PUBLIC "-//W3C//DTD HTML 4.01 Transitional//EN">
<html>
<head>
  <meta content="text/html;charset=ISO-8859-1" http-equiv="Content-Type">
</head>
<body bgcolor="#ffffff" text="#000000">
I made a modified version of g_covar that has this capability. I'll put
it in the user contributions later today.<br>
<br>
Ran.<br>
<br>
Dhananjay wrote:
<blockquote
 cite="midde8b174b0807300723i7059210bl9b6f3bdbc1f0851f@mail.gmail.com"
 type="cite">
  <div dir="ltr">Hello all,<br>
  <br>
I have done MD simulation of protein and using trajectories I did
covariance analysis. Using program g_covar with -ascii option a row
covariance matrix have been generated. <br>
  <br>
However, I an interested in Correlation matrix instead of Covariance. <br>
  <br>
Can any one tell me how to convert the covariance matrix into
correlation matrix or what is the relation between covariance and
correlation matrix. <br>
  <br>
I am not good in programming or mathematics, but if anyone could help
me and give me some direction, I will be happy to write own
program/script.<br>
  <br>
  <br>
Thanking you in advance,<br>
  <br>
&nbsp;<br>
-- Dhananjay<br>
  <br>
  </div>
  <pre wrap="">
<hr size="4" width="90%">
_______________________________________________
gmx-users mailing list    <a class="moz-txt-link-abbreviated" href="mailto:gmx-users@gromacs.org">gmx-users@gromacs.org</a>
<a class="moz-txt-link-freetext" href="http://www.gromacs.org/mailman/listinfo/gmx-users">http://www.gromacs.org/mailman/listinfo/gmx-users</a>
Please search the archive at <a class="moz-txt-link-freetext" href="http://www.gromacs.org/search">http://www.gromacs.org/search</a> before posting!
Please don't post (un)subscribe requests to the list. Use the 
www interface or send it to <a class="moz-txt-link-abbreviated" href="mailto:gmx-users-request@gromacs.org">gmx-users-request@gromacs.org</a>.
Can't post? Read <a class="moz-txt-link-freetext" href="http://www.gromacs.org/mailing_lists/users.php">http://www.gromacs.org/mailing_lists/users.php</a></pre>
</blockquote>
<br>
<br>
<pre class="moz-signature" cols="72">-- 
------------------------------------------------------
Ran Friedman
Postdoctoral Fellow
Computational Structural Biology Group (A. Caflisch)
Department of Biochemistry
University of Zurich
Winterthurerstrasse 190
CH-8057 Zurich, Switzerland
Tel. +41-44-6355593
Email: <a class="moz-txt-link-abbreviated" href="mailto:r.friedman@bioc.unizh.ch">r.friedman@bioc.unizh.ch</a>
Skype: ran.friedman
------------------------------------------------------
</pre>
</body>
</html>