<div dir="ltr">Hi,<br><br>how did you compile Gromacs? You have to speficify --enable-mpi to configure. How did you run it? Give the exact command line.<br><br>Roland<br><br><div class="gmail_quote">On Thu, Jul 31, 2008 at 4:40 PM,  <span dir="ltr">&lt;<a href="mailto:swolf@bph.rub.de">swolf@bph.rub.de</a>&gt;</span> wrote:<br>
<blockquote class="gmail_quote" style="border-left: 1px solid rgb(204, 204, 204); margin: 0pt 0pt 0pt 0.8ex; padding-left: 1ex;">Hi all,<br>
I&#39;m having trouble with the compilation of GROMACS on a Mac Pro (OS X).<br>
It&#39;s a &nbsp;machine with two Quad-Core Intel Xeon, so 8 nodes in all. As<br>
compiler I used the programs delivered with the Xcode tools 3.0 and for<br>
parallelisation the LAM/MPI package delivered with the Xcode tools. The<br>
problem now is: If I try to start a job on the 8 nodes, the program is<br>
started 8 times (one time each node) instead of one time and distributed<br>
on 8 nodes. The result is the same for GROMACS 3.3.1, 3.3.3 and the recent<br>
CVS. Does anybody have a suggestion? Is the problem more related to LAM<br>
then to GROMACS?<br>
Greetings<br>
Steffen<br>
_______________________________________________<br>
gmx-users mailing list &nbsp; &nbsp;<a href="mailto:gmx-users@gromacs.org">gmx-users@gromacs.org</a><br>
<a href="http://www.gromacs.org/mailman/listinfo/gmx-users" target="_blank">http://www.gromacs.org/mailman/listinfo/gmx-users</a><br>
Please search the archive at <a href="http://www.gromacs.org/search" target="_blank">http://www.gromacs.org/search</a> before posting!<br>
Please don&#39;t post (un)subscribe requests to the list. Use the<br>
www interface or send it to <a href="mailto:gmx-users-request@gromacs.org">gmx-users-request@gromacs.org</a>.<br>
Can&#39;t post? Read <a href="http://www.gromacs.org/mailing_lists/users.php" target="_blank">http://www.gromacs.org/mailing_lists/users.php</a><br>
</blockquote></div><br></div>