<table cellspacing="0" cellpadding="0" border="0" ><tr><td valign="top" style="font: inherit;">Hello guys,<br><br>i have a problem that on unfolding simulation my protein unfolds quickly within 500ps 70% and rest stable in entire simulation as this is the state of equilibrium in which gromacs equilibrate the system ,so we wann'a do an equilibrium MD for 1ns than have to extend to 6ns, it looks like hard because when we start a extended simulation,it takes previous .tpr file,<br>is anyone have idea how to perform this kind of simulation ?????<br><br><br><br>regards,<br><br><div><br><span style="color: rgb(56, 83, 118); font-family: comic sans ms;">Ravi Datta Sharma</span></div>  <div><span style="color: rgb(56, 83, 118); font-family: comic sans ms;">Lecturer,</span></div>  <div><span style="color: rgb(56, 83, 118); font-family: comic sans ms;">Bioinformatics,</span><br style="color: rgb(56, 83, 118); font-family: comic sans ms;"><span style="color:
 rgb(56, 83, 118); font-family: comic sans ms;">Department of Microbiology,<br>CCS Unversity,<br>Meerut</span><span style="color: rgb(56, 83, 118); font-family: comic sans ms;"><br>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; <br></span></div></td></tr></table><br>


      <!--1--><hr size=1></hr> Download prohibited? No problem. <a href="http://in.rd.yahoo.com/tagline_webmessenger_1/*http://in.webmessenger.yahoo.com/">CHAT</a> from any browser, without download.