<div dir="ltr">Hi,<br>&nbsp;Thanks for your reply.<br>Do you have any idea of how to run commands using scheduler command &quot;bsub&quot;<br><br>With Thanx,<br>Vivek<br><div class="gmail_quote">2008/8/20 Kukol, Andreas <span dir="ltr">&lt;<a href="mailto:a.kukol@herts.ac.uk">a.kukol@herts.ac.uk</a>&gt;</span><br>
<blockquote class="gmail_quote" style="border-left: 1px solid rgb(204, 204, 204); margin: 0pt 0pt 0pt 0.8ex; padding-left: 1ex;">mpirun -np &lt;number of processors&gt; mdrun &nbsp;various options... -np &lt;number of processors&gt;<br>

<br>
(all in one line)<br>
<br>
&gt;&gt;&gt;&gt;&gt;<br>
From: <a href="mailto:gmx-users-bounces@gromacs.org">gmx-users-bounces@gromacs.org</a> [mailto:<a href="mailto:gmx-users-bounces@gromacs.org">gmx-users-bounces@gromacs.org</a>] On Behalf Of vivek sharma<br>
Sent: 20 August 2008 12:44<br>
To: Discussion list for GROMACS users<br>
Subject: [gmx-users] MDRUN with MPIRUN<br>
<div><div></div><div class="Wj3C7c"><br>
Hi There,<br>
I am trying to run the gromacs with mpirun, but don&#39;t know the exact commands for running gromacs with mpirun.<br>
If, somebody can give the exact command to run mdrun with MPI.<br>
It will be of great help for me to do my job.<br>
<br>
Thanks in advance,<br>
Vivek<br>
</div></div>_______________________________________________<br>
gmx-users mailing list &nbsp; &nbsp;<a href="mailto:gmx-users@gromacs.org">gmx-users@gromacs.org</a><br>
<a href="http://www.gromacs.org/mailman/listinfo/gmx-users" target="_blank">http://www.gromacs.org/mailman/listinfo/gmx-users</a><br>
Please search the archive at <a href="http://www.gromacs.org/search" target="_blank">http://www.gromacs.org/search</a> before posting!<br>
Please don&#39;t post (un)subscribe requests to the list. Use the<br>
www interface or send it to <a href="mailto:gmx-users-request@gromacs.org">gmx-users-request@gromacs.org</a>.<br>
Can&#39;t post? Read <a href="http://www.gromacs.org/mailing_lists/users.php" target="_blank">http://www.gromacs.org/mailing_lists/users.php</a><br>
</blockquote></div><br></div>