<div dir="ltr">Hi,<br><br>I want to clarify a few of the things about the usage of g_rotacf (for rotational correlation function for molecules). In the manual it is given like the following:<br><br>g_rotacf -P 1 -nparm 2 -fft -n index -o rotacf-x-P1 -fa expfit-x-P1 -beginfit 2.5 -endfit 20.0<br>
<br>I understood that -f, -s options are needed to be included in the above list.<br><br>It is mentioned in the manual, that the above command will calculate the rotational function using a first order Legendre polynomial of the angle of a vector defined by the index file. <br>
(as I understand, -P 1 option is taking care of this. If I want to use the second order Legendre polynomials, -P 2 will do it for me I suppose)<br><br>The above command will also fit the calculated correlation function to a two parameter exponential (-nparm 2 is taking care of this I suppose). Does it mean that the calculated correlation function is expressed as a sum of three exponential terms with two variables along two directions ? What is the fit function by default is used here ? Is it exp(-l(l+1)Di) ?<br>
<br>There is also an option -fitfn in the list, what are these functions are meant for ?<br><br>-fft option is for using FFT for the computation of the correlation function if I am correct.<br><br>-fa option I dont have any idea about it.<br>
<br>Thanks and Regards in advance,<br><br>Ram.<br></div>