<div>Hi,</div>
<div>I&#39;m using Gromacs 3.3.3, installed with double precision. When I run genion with this command:</div>
<div>&nbsp;</div>
<div>genion_d -s *.tpr -o *.gro -g genion.log -pot pot.pdb -p *.top -neutral</div>
<div>&nbsp;</div>
<div>the following error message was generated:</div>
<div>------------------------------------------------------------------------</div>
<div>&nbsp;</div>
<div>Program genion_d Version 3.3.3</div>
<div>sourcecode file: init.c, line 69</div>
<div>&nbsp;</div>
<div>Fatal error:</div>
<div>run input file prakash.tpr was made for 32 nodes</div>
<div>while genion_d expected it to be for 1 node</div>
<div>------------------------------------------------------------------------------</div>
<div>&nbsp;</div>
<div>System is &quot;protein in water&quot;, dodecahedron box. Everything is fine till energy minimisation. genion is failing. </div>
<div>&nbsp;</div>
<div>Any clue??</div>
<div>&nbsp;</div>
<div>Thanks.<br>-- <br>&nbsp;&nbsp; _&nbsp;&nbsp;_<br>&nbsp;&nbsp;(_)(_)<br>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;(,,)<br>&nbsp;&nbsp; =()=<br>&nbsp;&nbsp;((__)\<br>&nbsp;&nbsp; _|L\_______/<br>&nbsp;&nbsp; The Lab Rats<br><br>When u r busy judging ppl, you&#39;ve no time to love&#39;em..&nbsp;&nbsp;-Nick Vujicic </div>