<div dir="ltr">Dear users,<br><br>I have given a command like the following to calculate the rotational auto correlation function:<br><br>&nbsp;g_rotacf -f .trr -s .tpr -P 2 -fft -o .xvg -b 0000 -e 10000&nbsp; -n .ndx -d <br><br>I want to use the second order Legendre polynomial to fit. I integrated the resulting .xvg file, to obtain the correlation time using:<br>
<br>g_analyze -f .xvg&nbsp; -integrate<br><br>The output is the following. Could some one help me in understanding it betterly.<br><br>Calculating the integral using the trapezium rule<br>Integral 1&nbsp;&nbsp; 120.92840&nbsp; +/-&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.00000<br>
&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; std. dev.&nbsp;&nbsp;&nbsp; relative deviation of<br>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; standard&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; ---------&nbsp;&nbsp; cumulants from those of<br>set&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; average&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; deviation&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; sqrt(n-1)&nbsp;&nbsp; a Gaussian distribition<br>
&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; cum. 3&nbsp;&nbsp; cum. 4<br>SS1&nbsp;&nbsp; 2.428352e-02&nbsp;&nbsp; 2.972849e-02&nbsp;&nbsp; 4.204243e-04&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 9.301&nbsp;&nbsp; 120.228<br><br><br>Which value corresponds to correlation time and in which units ?<br>
<br>Thanks in advance.<br><br>Ram.<br></div>