<div dir="ltr">Hi gmx-users,<br>I have doubt about grompp and tpbconv commands. I am telling like this <br>If I run grompp each time with interval of 1ns until 10ns md simulations, considered as one system. By using tpbconv eachtime with same interval time 1ns unitl 10ns simulation considered as a another system. Both of these systems contain same molecules,number of atoms,parameters except using grompp and tpbconv.&nbsp; Now these two systems make any difference in RMSD and other analysis.<br>
<br>It seems grompp should use only when change in the parameters or else&nbsp; can use tpbconv for extending the run <br>am i right?<br><br>Thanks alot for your any suggestions<br></div>