<div dir="ltr">Hi there,<br><br>My apologies for asking question from basics.<br>I have one doubt regarding order of Position restrained and Energy minimization. While running Position restrained, it soaks water molecule well within the protein molecule. In doing so on rearranging atoms it will again raise the energy of system (if I am not wrong). So, do we need to run Energy minimization again ?<br>
If not, then why ?<br><br>With Thanks,<br>Vivek<br></div>