<div dir="ltr">Hi There,<br>I am running gromacs parellal version on cluster, with different -np options.<br>On analyzing the 5 nsec trajectory using ngmx, I am finding difference in the trajectory of two similar runs (only thing varying in two runs in -np i.e 20 and 64 ), where mdp file and input files are same in two cases.<br>
I am wondering why I am getting this difference in two trajectories ?<br>I am looking for the advice whether I did something wrong or what may be the probable reason for this difference.<br>Also, I am not able to run gromacs faster by increasing the -np issue, Is there any max limit for scaling gromacs on parellal cluster ?<br>
<br>With Thanks,<br>Vivek<br></div>