<div dir="ltr">Dear users,<br><br>I am trying to run a simulation of SNA-protein complex.<br>I have changed DA,DC,DT,DG to DADE,DCYT,DTHY,DGUA and all &#39; to *.<br>while running the PDB2GMX command, I am getting following error<br>
<br><b>Program pdb2gmx, VERSION 3.3.2<br>Source code file: pdb2gmx.c, line: 421<br><br>Fatal error:<br>Atom P in residue THF 2 not found in rtp entry with 39 atoms<br>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; while sorting atoms<br></b><br><br>but THF 2 atom is not present in my pdb file.How can I remove this error?<br>
<br>Thanx in advance<br><br clear="all"><br>-- <br>PRASUN (ASHOKA)<br>
</div>