<P>
&nbsp; <BR>
Hi all , <BR>
I am having general doubts regaring GROMACS those are unclear me writing you<BR>
1. If a system contain equal number of atoms run these systems in&nbsp; GROMACS and in AMBER why former one simulates faster than second one?<BR>
<BR>
2.If do minisation while running shows that<BR>
&nbsp; Back Off! I just backed up step53.pdb what may be the reason?<BR>
<BR>
Could anyone suggest me<BR>
Thanks in advance.<BR>

</P>
<br><br>
<Table border=0 Width=644 Height=57 cellspacing=0 cellpadding=0 style='font-family:Verdana;font-size:11px;line-height:15px;'><TR><td><a href='http://adworks.rediff.com/cgi-bin/AdWorks/click.cgi/www.rediff.com/signature-home.htm/1050715198@Middle5/2606998_2599290/2602379/1?PARTNER=3&OAS_QUERY=null' target=new ><img src ='http://imadworks.rediff.com/cgi-bin/AdWorks/adimage.cgi/2606998_2599290/creative_2602379.gif'  alt='Black578x38_banner2.gif'  border=0></a></td></TR></Table>