<div dir="ltr"><div><br>Thank you Justin and Sudheer.</div>
<div>I had already made a solution to my problem, but didn&#39;t know whether it was right. To confirm it I want to discuss it with you.</div>
<div>&nbsp;</div>
<div>After doing grompp to add Na+ to the water box I have done make_ndx with .gro file. Then in the index file I merged the index no. of 2 [NA+] into the [SOL] group and deleted the [NA+] group. After that I could do the position restrained grompp with the file that&nbsp;2 Na+ ions.</div>

<div>&nbsp;</div>
<div>I want to know is it a correct method or not.</div>
<div>&nbsp;</div>
<div>Thanking you in advance,</div>
<div>&nbsp;</div>
<div>with regards</div>
<div>&nbsp;</div>
<div>CHITRITA.</div></div>