<div dir="ltr">Hi gmx-users,<br>I want to use tip3p water model when I mention this model with flag -cs by genbox command it showed that no program for tip3p.gro, <br>from this link <br><a href="http://www.gromacs.org/pipermail/gmx-users/2007-February/025712.html">http://www.gromacs.org/pipermail/gmx-users/2007-February/025712.html</a><br>
I understood that mention -spc water model in genbox command but in .top file edit #tip3p.itp# so it can take as tip3p water model.<br><br>1.My doubt is I am mentioning -spc in genbox command but how it will change to tip3p by simply editing in .top file?<br>
2. From literature I found that tip3p HOH angle 104.5 degree but spc model HOH angle 109.4 degree and it shows ideal tetral hedral shape, <br>&nbsp; So mostly people are prefer to use tip3p rather than spc, am i right? <br><br>
Can clear me this doubt <br>Thanks in advance.<br><br></div>