<div dir="ltr"><div>Hi, gmx-users</div>
<div>&nbsp;</div>
<div>i want to use gromacs to pull a small ligand through a protein channel and study the interaction between the ligand and the protein during this process.&nbsp;However, i&nbsp;have not found out any&nbsp;useful information&nbsp;about steered molecular dynamics(SMD)&nbsp;using Gromacs software.</div>

<div>&nbsp;</div>
<div>What&nbsp;are the differences between SMD and general MD in using Gromacs&nbsp;and how to set up the related parameters?</div>
<div>&nbsp;</div>
<div>Thanks&nbsp;a lot.</div>
<div>&nbsp;</div>
<div>Dove.&nbsp;</div></div>