<table cellspacing="0" cellpadding="0" border="0" ><tr><td valign="top" style="font: inherit;">Hello everyone<br><br>is there any idea how can i calculate rmsd for a given helix or all helix in a protein from a trejectory???<br><br><br>-Ravi<br><br><div><br><span style="color: rgb(56, 83, 118); font-family: comic sans ms;">Ravi Datta Sharma</span></div>  <div><span style="color: rgb(56, 83, 118); font-family: comic sans ms;">Lecturer,</span></div>  <div><span style="color: rgb(56, 83, 118); font-family: comic sans ms;">Bioinformatics,</span><br style="color: rgb(56, 83, 118); font-family: comic sans ms;"><span style="color: rgb(56, 83, 118); font-family: comic sans ms;">Department of Microbiology,<br>CCS Unversity,<br>Meerut</span><span style="color: rgb(56, 83, 118); font-family: comic sans
 ms;"><br>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; <br></span></div></td></tr></table><br>Send free SMS to your Friends on Mobile from your Yahoo! Messenger. Download Now! http://messenger.yahoo.com/download.php