<div>I have a *pdb file for a polymer box which I want to use. I defined the residues (the first, the last and the inner monomers). </div>
<div>Pdb2gmx runs, but I obtain a &quot;soup&quot; of monomers instead of N chains a M monomers each.</div>
<div>My problem now is how to connect the monomers. What is the best way to do so?</div>
<div>&nbsp;</div>
<div>Regards,</div>
<div>Andrea</div>
<div>&nbsp;</div>
<div>&nbsp;</div>