<div>Thanks, so how to edit&nbsp; a residue name ? I am confused.&nbsp; sorry about such simple question.&nbsp; </div>
<div>-Xianghong Qi<br><br></div>
<div class="gmail_quote">On Tue, Oct 21, 2008 at 9:01 PM, Mark Abraham <span dir="ltr">&lt;<a href="mailto:Mark.Abraham@anu.edu.au">Mark.Abraham@anu.edu.au</a>&gt;</span> wrote:<br>
<blockquote class="gmail_quote" style="PADDING-LEFT: 1ex; MARGIN: 0px 0px 0px 0.8ex; BORDER-LEFT: #ccc 1px solid">
<div class="Ih2E3d">xianghong qi wrote:<br>
<blockquote class="gmail_quote" style="PADDING-LEFT: 1ex; MARGIN: 0px 0px 0px 0.8ex; BORDER-LEFT: #ccc 1px solid">Hello, everyone,<br>I want to create a pdb file for methane pair . I can make methane pair from MOE and then save to pdb file format without any residue name there.<br>
The question is that I can&#39;t convert pdb file to .gro file from gromacs without residue name. &nbsp;Anyone has any idea about this question. I appreciate<br>your help.<br></blockquote><br></div>You don&#39;t need a .gro file for itself.. see <a href="http://wiki.gromacs.org/index.php/Coordinate_File#On_the_need_for_a_.gro_file" target="_blank">http://wiki.gromacs.org/index.php/Coordinate_File#On_the_need_for_a_.gro_file</a><br>
<br>You&#39;ll need a residue name to get a topology defined, so edit one in.<br><br>Mark<br>_______________________________________________<br>gmx-users mailing list &nbsp; &nbsp;<a href="mailto:gmx-users@gromacs.org" target="_blank">gmx-users@gromacs.org</a><br>
<a href="http://www.gromacs.org/mailman/listinfo/gmx-users" target="_blank">http://www.gromacs.org/mailman/listinfo/gmx-users</a><br>Please search the archive at <a href="http://www.gromacs.org/search" target="_blank">http://www.gromacs.org/search</a> before posting!<br>
Please don&#39;t post (un)subscribe requests to the list. Use the www interface or send it to <a href="mailto:gmx-users-request@gromacs.org" target="_blank">gmx-users-request@gromacs.org</a>.<br>Can&#39;t post? Read <a href="http://www.gromacs.org/mailing_lists/users.php" target="_blank">http://www.gromacs.org/mailing_lists/users.php</a><br>
</blockquote></div><br><br clear="all"><br>-- <br>Some people make the world more special just by being in it.<br>