<html>
<head>
<style>
.hmmessage P
{
margin:0px;
padding:0px
}
body.hmmessage
{
FONT-SIZE: 10pt;
FONT-FAMILY:Tahoma
}
</style>
</head>
<body class='hmmessage'>
Hi everybody.<br>I'm working a system with a peptide embedded in a lipid bilayer and I try to get the two-dimentional g_rdf for the upper leaflet around the peptide with the -xy option and periodic boundary conditions. But my RDF doesn't go to 1. When a used -nopbc i get almost the same result (just multiplied by a constant) and the RDF is always cutted at the half of size of the box.<br><br>Any help will be appreciated.<br><br>Thanks in advance.<br><br /><hr />Obtén 5GB de almacenamiento completamente gratis, sólo ven a  <a href='http://skydrive.live.com' target='_new'>Skydrive</a></body>
</html>