<html>
<head>
<style>
.hmmessage P
{
margin:0px;
padding:0px
}
body.hmmessage
{
FONT-SIZE: 10pt;
FONT-FAMILY:Tahoma
}
</style>
</head>
<body class='hmmessage'>
<br>

<meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=unicode">
<meta name="Generator" content="Microsoft SafeHTML">
<style>
.ExternalClass .EC_hmmessage P
{padding:0px;}
.ExternalClass body.EC_hmmessage
{font-size:10pt;font-family:Tah</style>Hi everybody.<br>I'm working a system with a peptide embedded in a lipid bilayer and I try to get the two-dimentional g_rdf for the upper leaflet around the peptide with the -xy option and periodic boundary conditions. But my RDF doesn't go to 1. When a used -nopbc i get almost the same result (just multiplied by a constant) and the RDF is always cutted at the half of size of the box.<br><br>Any help will be appreciated.<br><br>Thanks in advance.<br><br><a href="http://skydrive.live.com" target="_blank"></a>
<br /><hr />Conoce el perfil completo de todos tus amigos de Windows Live Messenger justo aquí: <a href='http://home.services.spaces.live.com/' target='_new'>Windows Live Spaces</a></body>
</html>