<P>
&nbsp; Does this mean thai I can't recompile gromacs because I had used a binary package for <BR>
installing gromacs.<BR>
Isn't there any way in which I can compile gromacs, without having to install it again?<BR>
<BR>
<BR>
<BR>
<BR>
On Thu, 06 Nov 2008 Martin Höfling wrote :<BR>
&gt;You're probably not in a source directory.<BR>
&gt;<BR>
&gt;As you mentioned - you need an mpi-enabled version (linked vs your<BR>
&gt;installed MPI library).<BR>
&gt;<BR>
&gt;If you're unexperienced in compiling, check first if there are binary<BR>
&gt;packages (with mpi) for OS X.<BR>
&gt;<BR>
&gt;If not, here the roughly sketched steps:<BR>
&gt;- obtain the source (tar.gz or checkout via cvs)<BR>
&gt;- ./bootstrap (only when cvs version used)<BR>
&gt;- Configure via ./configure. The interesting options for you migth be:<BR>
&gt; &nbsp; &nbsp; &nbsp;&nbsp; &nbsp; &nbsp;--enable-mpi --program-suffix=&quot;_mpi&quot;<BR>
&gt;- make mdrun<BR>
&gt;- make install (as superuser or specify a prefix for user installation<BR>
&gt;in ./configure)<BR>
&gt;<BR>
&gt;The gromacs website and wiki contains more information about the steps.<BR>
&gt;<BR>
&gt;Good luck<BR>
&gt; &nbsp; &nbsp; &nbsp;Martin<BR>
&gt;<BR>

</P>
<br><br>
<Table border=0 Width=644 Height=57 cellspacing=0 cellpadding=0 style='font-family:Verdana;font-size:11px;line-height:15px;'><TR><td><a href='http://adworks.rediff.com/cgi-bin/AdWorks/click.cgi/www.rediff.com/signature-default.htm/1050715198@Middle5/2206641_2199021/2201651/1?PARTNER=3&OAS_QUERY=null' target=new ><img src ='http://imadworks.rediff.com/cgi-bin/AdWorks/adimage.cgi/2206641_2199021/creative_2201651.gif'  alt='Rediff Shopping'  border=0></a></td></TR></Table>