<div>The time difference is : for simulation with every 100ps output, 160ns/day; for simulation with every 0.1ps output, It has been running for 4 days, only wrote to 2300ps . I am not sure the local hard disk since I run my simulation in some cluster.&nbsp; Thanks. </div>

<div>-Xianghong Qi</div>
<div><br><br>&nbsp;</div>
<div class="gmail_quote">On Sat, Nov 8, 2008 at 11:09 AM, Yang Ye <span dir="ltr">&lt;<a href="mailto:leafyoung@yahoo.com">leafyoung@yahoo.com</a>&gt;</span> wrote:<br>
<blockquote class="gmail_quote" style="PADDING-LEFT: 1ex; MARGIN: 0px 0px 0px 0.8ex; BORDER-LEFT: #ccc 1px solid">More details please.<br>Local hard disk?<br>How much the time difference?<br><font color="#888888"><br>YY</font> 
<div>
<div></div>
<div class="Wj3C7c"><br><br>On 11/8/08 12:41 PM, xianghong qi wrote:<br></div></div>
<blockquote class="gmail_quote" style="PADDING-LEFT: 1ex; MARGIN: 0px 0px 0px 0.8ex; BORDER-LEFT: #ccc 1px solid">
<div>
<div></div>
<div class="Wj3C7c">Hello, all:<br>&nbsp;I compare the two simulations with different output frequency for .xtc file in same machine. One with low frequency runs &nbsp;much faster than the one with high frequency. Is that reasonable? I think the frequency shouldn&#39;t affect the simulation speed. &nbsp;&nbsp;Anyone has idea about this situation? &nbsp;Thanks. &nbsp;-Xianghong Qi &nbsp;<br>
-- <br>Some people make the world more special just by being in it.<br></div></div>------------------------------------------------------------------------ 
<div class="Ih2E3d"><br><br>_______________________________________________<br>gmx-users mailing list &nbsp; &nbsp;<a href="mailto:gmx-users@gromacs.org" target="_blank">gmx-users@gromacs.org</a><br><a href="http://www.gromacs.org/mailman/listinfo/gmx-users" target="_blank">http://www.gromacs.org/mailman/listinfo/gmx-users</a><br>
Please search the archive at <a href="http://www.gromacs.org/search" target="_blank">http://www.gromacs.org/search</a> before posting!<br>Please don&#39;t post (un)subscribe requests to the list. Use the www interface or send it to <a href="mailto:gmx-users-request@gromacs.org" target="_blank">gmx-users-request@gromacs.org</a>.<br>
Can&#39;t post? Read <a href="http://www.gromacs.org/mailing_lists/users.php" target="_blank">http://www.gromacs.org/mailing_lists/users.php</a><br></div></blockquote>
<div>
<div></div>
<div class="Wj3C7c">_______________________________________________<br>gmx-users mailing list &nbsp; &nbsp;<a href="mailto:gmx-users@gromacs.org" target="_blank">gmx-users@gromacs.org</a><br><a href="http://www.gromacs.org/mailman/listinfo/gmx-users" target="_blank">http://www.gromacs.org/mailman/listinfo/gmx-users</a><br>
Please search the archive at <a href="http://www.gromacs.org/search" target="_blank">http://www.gromacs.org/search</a> before posting!<br>Please don&#39;t post (un)subscribe requests to the list. Use the www interface or send it to <a href="mailto:gmx-users-request@gromacs.org" target="_blank">gmx-users-request@gromacs.org</a>.<br>
Can&#39;t post? Read <a href="http://www.gromacs.org/mailing_lists/users.php" target="_blank">http://www.gromacs.org/mailing_lists/users.php</a><br></div></div></blockquote></div><br><br clear="all"><br>-- <br>Some people make the world more special just by being in it.<br>