Hi,<br><br>i&#39;m trying to write each frame from the bebining time=0.0 to the end time=6000 to a separate file, but it writes only the 1frame at time 0.0:<br><br>trjconv -f 1ktz_p1_em.gro -s 1ktz_p1_em.tpr -o 1ktz_0.pdb -b 0.0 -e 6000.0 -sep<br>
<br>Reading frames from gro file &#39;GROningen MAchine for Chemical Simulation&#39;, 1148 atoms.<br>Reading frame&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0 time&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.000<br>Precision of 1ktz_p1_em.gro is 0.001 (nm)<br>Last frame&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0 time&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.000<br>
<br>i guess i should provide index.ndx of frames.ndx.<br>i havn&#39;t found anithing about what to write in these files and in what format.<br><br><br>Tania<br>