<P>
&nbsp; <BR>
Hi all, <BR>
I am trying to make centre of the bilayer so I used following command line<BR>
trjconv -f 20nspopc.xtc -centre rect -o 20nstrjout.xtc -n water.ndx based on http://www.gromacs.org/pipermail/gmx-users/2003-June/005995.html<BR>
here I selected 3 (solution) again 3 (solution) for output of the selecting group<BR>
this command ran fine<BR>
when I feed 20nstrjout.xtc to g_density <BR>
g_density -f 20nstrjout.xtc -s em.tpr -d z -o waterden -n water.ndx<BR>
Group&nbsp; &nbsp;  0 (&nbsp; &nbsp; &nbsp; System) has 14036 elements<BR>
Group&nbsp; &nbsp;  1 (&nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; POPC) has&nbsp; 6656 elements<BR>
Group&nbsp; &nbsp;  2 (&nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp;  SOL) has&nbsp; 7380 elements<BR>
Group&nbsp; &nbsp;  3 (&nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp;  SOL) has&nbsp; 7380 elements<BR>
Select a group: 3<BR>
Selected 3: 'SOL'<BR>
Reading frame&nbsp; &nbsp; &nbsp;  0 time&nbsp; &nbsp; 0.000&nbsp;  Segmentation fault<BR>
<BR>
where is the mistake happening? <BR>
<BR>
Could anyone tell me<BR>
<BR>
Thanks in advance
</P>
<br><br>
<Table border=0 Width=644 Height=57 cellspacing=0 cellpadding=0 style='font-family:Verdana;font-size:11px;line-height:15px;'><TR><td><a href='http://adworks.rediff.com/cgi-bin/AdWorks/click.cgi/www.rediff.com/signature-home.htm/1050715198@Middle5/2657076_2649302/2660191/1?PARTNER=3&OAS_QUERY=null' target=new ><img src ='http://imadworks.rediff.com/cgi-bin/AdWorks/adimage.cgi/2657076_2649302/creative_2660191.gif'  alt='ICL'  border=0></a></td></TR></Table>