<p>I&#39;m trying to get Gromacs installed on our systems, but I&#39;ve been running into one error after another. We are running CentOS5 x86-64 with all the latest updates.<br></p><p>I&#39;ve got the following packages downloaded<br>
lam-7.1.4<br>fftw-3.2<br>gsl-1.11<br>gromacs-4.0<br></p><p>I installed them in the following order with the following commands:</p><p>cd lam-7.1.4 &amp;&amp; ./configure &amp;&amp; make &amp;&amp; make install<br>cd ../fftw-3.2 &amp;&amp; ./configure --enable-float &amp;&amp; make &amp;&amp; make install<br>
cd ../gsl-1.11 &amp;&amp; ./configure &amp;&amp; make &amp;&amp; make install<br>cd ../gromacs-4.0 &amp;&amp; ./configure --enable-mpi &amp;&amp; make &amp;&amp; make install &amp;&amp; make links<br></p><p>I&#39;ve got two problems when I try to run an MPI-based simulation. First, the system complains that libgslcblas.so.0 is missing. Searching for this finds that it has been installed in /usr/local/lib. &#39;ldconfig -p&#39; doesn&#39;t show the library installed, and from what I understand, the library should be installed in /usr/local/lib64.<br>
</p><p>Secondly, shouldn&#39;t the configure option of &#39;--enable-mpi&#39; create an executable named mdrun_mpi? I have used this in previous installations, but it doesn&#39;t seem to have been compiled.</p><p></p><p>Any help would be greatly appreciated.</p>
<p>Cheers,<br>-Nicholas Geraedts<br></p>