<P>
&nbsp; <BR>
Hi everyone,<BR>
&nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; I will like to do Replica exchange simulation on a peptide. We have a single <BR>
machine with 4 cpus and the gromacs3.3.2 is installed. <BR>
Thus I will be able to select only 4 temperature values. I came across the&nbsp; &quot;T-REMD&quot; caculator <BR>
for temperature distributions . However over a high range of temperature there are more than <BR>
4, values given in the optimal tempearture distribution as obtained as an output from the &quot;T-<BR>
REMD&quot; calculator.&nbsp; <BR>
How to choose the best possible 4 temperature values.<BR>
<BR>
Thanks in advance,<BR>
Sarbani 
</P>
<br><br>
<Table border=0 Width=644 Height=57 cellspacing=0 cellpadding=0 style='font-family:Verdana;font-size:11px;line-height:15px;'><TR><td><a href='http://adworks.rediff.com/cgi-bin/AdWorks/click.cgi/www.rediff.com/signature-default.htm/1050715198@Middle5/2206641_2199021/2201651/1?PARTNER=3&OAS_QUERY=null' target=new ><img src ='http://imadworks.rediff.com/cgi-bin/AdWorks/adimage.cgi/2206641_2199021/creative_2201651.gif'  alt='Rediff Shopping'  border=0></a></td></TR></Table>