<div>Hi, Mark:</div>
<div>I put the energygrps = Methane1 Methane2 into mdp file. </div>
<div>grompp&nbsp; gives one warning: </div>
<div>&nbsp;</div>
<div>WARNING 1 [file conf.top, line 47]:<br>&nbsp; Can not exclude the lattice Coulomb energy between energy groups</div>
<div>&nbsp;</div>
<div>then grompp terminated.&nbsp; </div>
<div>Could you give me a hint about his problem?&nbsp; Thanks.</div>
<div>-Xianghong Qi<br><br></div>
<div class="gmail_quote">On Wed, Nov 19, 2008 at 3:54 AM, xianghong qi <span dir="ltr">&lt;<a href="mailto:xianghong001@gmail.com">xianghong001@gmail.com</a>&gt;</span> wrote:<br>
<blockquote class="gmail_quote" style="PADDING-LEFT: 1ex; MARGIN: 0px 0px 0px 0.8ex; BORDER-LEFT: #ccc 1px solid">
<div>Thanks, Mark. </div>
<div>-Xianghong Qi<font color="#888888"><br><br></font></div>
<div>
<div></div>
<div class="Wj3C7c">
<div class="gmail_quote">On Wed, Nov 19, 2008 at 3:46 AM, Mark Abraham <span dir="ltr">&lt;<a href="mailto:Mark.Abraham@anu.edu.au" target="_blank">Mark.Abraham@anu.edu.au</a>&gt;</span> wrote:<br>
<blockquote class="gmail_quote" style="PADDING-LEFT: 1ex; MARGIN: 0px 0px 0px 0.8ex; BORDER-LEFT: #ccc 1px solid">
<div>xianghong qi wrote:<br>
<blockquote class="gmail_quote" style="PADDING-LEFT: 1ex; MARGIN: 0px 0px 0px 0.8ex; BORDER-LEFT: #ccc 1px solid">Hi, Mark:<br>&nbsp;for these two cases<br>energygrp_excl &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; = Methane1 Methane2<br>and &nbsp;energygrp_excl &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; = methane1 methane2<br>
&nbsp;I got same error: methane1(or Methane1 ) is not energy group.<br></blockquote><br></div>OK, so now that it&#39;s a group, you need it to be an energy group - see energygrps. 
<div>
<div></div>
<div><br><br>Mark<br>_______________________________________________<br>gmx-users mailing list &nbsp; &nbsp;<a href="mailto:gmx-users@gromacs.org" target="_blank">gmx-users@gromacs.org</a><br><a href="http://www.gromacs.org/mailman/listinfo/gmx-users" target="_blank">http://www.gromacs.org/mailman/listinfo/gmx-users</a><br>
Please search the archive at <a href="http://www.gromacs.org/search" target="_blank">http://www.gromacs.org/search</a> before posting!<br>Please don&#39;t post (un)subscribe requests to the list. Use the www interface or send it to <a href="mailto:gmx-users-request@gromacs.org" target="_blank">gmx-users-request@gromacs.org</a>.<br>
Can&#39;t post? Read <a href="http://www.gromacs.org/mailing_lists/users.php" target="_blank">http://www.gromacs.org/mailing_lists/users.php</a><br></div></div></blockquote></div><br><br clear="all"><br></div></div>
<div>
<div></div>
<div class="Wj3C7c">-- <br>Some people make the world more special just by being in it.<br></div></div></blockquote></div><br><br clear="all"><br>-- <br>Some people make the world more special just by being in it.<br>