<div dir="ltr"><div class="gmail_quote"><blockquote class="gmail_quote" style="border-left: 1px solid rgb(204, 204, 204); margin: 0pt 0pt 0pt 0.8ex; padding-left: 1ex;"><table border="0" cellpadding="0" cellspacing="0"><tbody><tr>
<td style="font-family: inherit; font-style: inherit; font-variant: inherit; font-weight: inherit; font-size: inherit; line-height: inherit; font-size-adjust: inherit; font-stretch: inherit;" valign="top"><br>Supposed I have a .gro file of 38 molecules of A which are already in equilibrated conformations. Now I want to transform 15 molecules of A into B therefore I will have the binary mixture of A/B with 13:15 molar ratio in the final structure. How can I do this? Any suggestions will be appreciated.<br>
</td></tr></tbody></table></blockquote><div><br>Maybe open A &amp; B in vmd together, and then save them as one PDB? Omer. <br></div></div></div>