<html>
<head>
<style>
.hmmessage P
{
margin:0px;
padding:0px
}
body.hmmessage
{
font-size: 10pt;
font-family:Verdana
}
</style>
</head>
<body class='hmmessage'>
Hi,<br><br>The molecule you want to insert should be a single charge group.<br>I guess you have miore than one charge group in the molecule.<br><br>I will add a check in the code for this, so you get a more<br>comprehensible error message.<br><br>Berk<br><br>&gt; Date: Wed, 3 Dec 2008 12:34:23 +0100<br>&gt; From: poblete@mpip-mainz.mpg.de<br>&gt; To: gmx-users@gromacs.org<br>&gt; Subject: [gmx-users] test molecule insertion<br>&gt; <br>&gt; Hi<br>&gt; I have trouble inserting molecules for test particle insertion (with <br>&gt; atoms there is no problem at all).<br>&gt; I have defined my conf.gro, topology and index files, but it keeps <br>&gt; saying that<br>&gt; "Number of atoms in trajectory (7000) is not equal the number in the run <br>&gt; input file (7005) minus the number of atoms to insert (1)"<br>&gt; How can I define the number of atoms to insert?<br>&gt; <br>&gt; greets<br>&gt; <br>&gt; s.<br>&gt; <br>&gt; _______________________________________________<br>&gt; gmx-users mailing list    gmx-users@gromacs.org<br>&gt; http://www.gromacs.org/mailman/listinfo/gmx-users<br>&gt; Please search the archive at http://www.gromacs.org/search before posting!<br>&gt; Please don't post (un)subscribe requests to the list. Use the <br>&gt; www interface or send it to gmx-users-request@gromacs.org.<br>&gt; Can't post? Read http://www.gromacs.org/mailing_lists/users.php<br><br /><hr />Express yourself instantly with MSN Messenger! <a href='http://clk.atdmt.com/AVE/go/onm00200471ave/direct/01/' target='_new'>MSN Messenger</a></body>
</html>