Hello Mark and Justin,<br><br>Thank you very much for your responce.<br>I edited the .bashrc file which is in my home directory.<br>I opened .bashrc file using vi and added &quot;source /usr/local/gromacs/bin/GMXRC&quot; at the last line.<br>
And then, I started Cygwin again. However, an error mesage (bash: /usr/local/gromacs/bin/GMXRC: No such file or directory) is showed when I start Cygwin. In addition, when I enter the command &quot;luck&quot; for gromacs, I can&#39;t see the correct responce (i.e. &quot;Whatever Happened to Pong ?&quot; (F. Black))<br>
Could you please tell me your suggestion? <br>I am using Cygwin on Windows Vista Enterprise.<br><br>Hideya<br><br><br><div class="gmail_quote">2008/12/15 Mark Abraham <span dir="ltr">&lt;<a href="mailto:Mark.Abraham@anu.edu.au">Mark.Abraham@anu.edu.au</a>&gt;</span><br>
<blockquote class="gmail_quote" style="border-left: 1px solid rgb(204, 204, 204); margin: 0pt 0pt 0pt 0.8ex; padding-left: 1ex;">Hideya Nakamura wrote:<br>
<blockquote class="gmail_quote" style="border-left: 1px solid rgb(204, 204, 204); margin: 0pt 0pt 0pt 0.8ex; padding-left: 1ex;"><div class="Ih2E3d">
Hello,<br>
<br>
I try to install GROMACS using Cygwin on my Windows PC.<br>
<br></div>
I have already installed fftw, and then I will install GROMACS based on a instruction on <a href="http://wiki.gromacs.org" target="_blank">wiki.gromacs.org</a> &lt;<a href="http://wiki.gromacs.org/" target="_blank">http://wiki.gromacs.org/</a>&gt; (<a href="http://wiki.gromacs.org/index.php/Cygwin_HOWTO" target="_blank">http://wiki.gromacs.org/index.php/Cygwin_HOWTO</a>).<div class="Ih2E3d">
<br>
<br>
In this instruction, there is a description &quot;#6 Edit your login files to source /usr/local/gromacs/bin/GMXRC<br>
<br>
(or manually add /usr/local/gromacs/man to the MANPATH and check that /usr/local/bin is in the PATH).&quot;<br>
<br>
However, I can&#39;t edit my log in files. Could someone give me how to edit my log in files by using Cygwin?<br>
</div></blockquote>
<br>
Probably you&#39;re using bash shell, so in your home directory, edit the file .bashrc and add the line &quot;source /usr/local/gromacs/bin/GMXRC&quot; (or as appropriate for wherever you installed GROMACS), and then open a new shell. This way the GROMACS environment will always be configured right for you.<br>

<br>
Mark<br>
_______________________________________________<br>
gmx-users mailing list &nbsp; &nbsp;<a href="mailto:gmx-users@gromacs.org" target="_blank">gmx-users@gromacs.org</a><br>
<a href="http://www.gromacs.org/mailman/listinfo/gmx-users" target="_blank">http://www.gromacs.org/mailman/listinfo/gmx-users</a><br>
Please search the archive at <a href="http://www.gromacs.org/search" target="_blank">http://www.gromacs.org/search</a> before posting!<br>
Please don&#39;t post (un)subscribe requests to the list. Use the www interface or send it to <a href="mailto:gmx-users-request@gromacs.org" target="_blank">gmx-users-request@gromacs.org</a>.<br>
Can&#39;t post? Read <a href="http://www.gromacs.org/mailing_lists/users.php" target="_blank">http://www.gromacs.org/mailing_lists/users.php</a><br>
</blockquote></div><br>