<table cellspacing="0" cellpadding="0" border="0" ><tr><td valign="top" style="font: inherit;">Hi&nbsp; all,<br>
I did a simulation of unusual protein in pure methanol for 1 ns but in
final results there was a bad contact of methanol molecule (no. 508)
with carbonyl oxygen of the acetyl group of&nbsp; the N terminal. I was
trying to remove this particular molecule and wanted to extend the run
but same problem of character coding of .trr and .tpr file. But I do
not want to start the fresh run of 1 ns because other methanol molecule
will take its place. In extending of run there is need of these two
files. Looking for suggestions.<br>
With lot of Thanks<br>
<br>
</td></tr></table><br>



      <!--2--><hr size=1></hr> Unlimited freedom, unlimited storage. <a href="http://in.rd.yahoo.com/tagline_mail_2/*http://help.yahoo.com/l/in/yahoo/mail/yahoomail/tools/tools-08.html/">Get it now</a>