Hello everyone, <br>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; While trying to do the RMSD analysis of my trajectory file I am facing the error &quot; Too many iterations in routine JACOBI&quot;. I have gone through the archives which suggests that such problem arises if there is mismatch between the reference structure and trajectory. However in my case the problem lies somewhere else because, using the same .tpr file and .trr file I have done RMSD analysis earlier also and it worked fine.&nbsp; The g_rms program is giving error but, for the same set of input files g_rmsdist is working fine.<br>
&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; Kindly help.<br>Regards,<br>Nishtha<br>