<P>
&nbsp; Hi,<BR>
&nbsp; &nbsp;  I had previously ran a replica exchange molecular dynamics simulation for 10ns. There <BR>
were 17 &quot;.tpr&quot; input files for 17 replicas at 17 different temperatures.<BR>
&nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp;  However, the run had stopped and now I need to restart it. I had generated 17 &quot;.tpr&quot; <BR>
files for the rest of the simulation left, using the&nbsp; command &quot;tpbconv&quot;, that is usually used for <BR>
generating &quot;.tpr&quot; file to restart a &quot;md&quot; run. <BR>
&nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; Then again I gave the command for &quot;mdrun&quot; using &quot;replex&quot; option such that the input <BR>
files are the 17 new restart &quot;.tpr &quot; files. <BR>
<BR>
Is this the right way to restart the replica exchange molecular dynamics simulation? Will the <BR>
trajectories of the 17 replicas start from the point inteneed and perform replica exchange as <BR>
per the command?<BR>
Any suggestion will be of great help.<BR>
Thanks in advance.<BR>
<BR>
Yours sincerely,<BR>
Sarbani 
</P>
<br><br>