Dear all,<br><br>Am trying to do simulation of DPPC membrane.Am using ffgmx force field,because other force fields doesnt have DPP residue,so got an error saying &quot;Residue DPP not in topology database.<br><br>So i generated topology file using pdb2gmx -ff gmx -f inp.pdb -o out.gro<br>
<br>now after few more steps i updated topology again to run grompp..<br><br>on grompp am getting an error saying <br><br>&quot;ERROR 0 [file &quot;topol.top&quot;, line 30026]:<br>&nbsp; No default Proper Dih. types<br>ERROR 0 [file &quot;topol.top&quot;, line 30027]:<br>
&nbsp; No default Proper Dih. types<br>ERROR 0 [file &quot;topol.top&quot;, line 30066]:<br>&nbsp; No default Proper Dih. types<br>ERROR 0 [file &quot;topol.top&quot;, line 30067]:<br>&nbsp; No default Proper Dih. types<br>ERROR 0 [file &quot;topol.top&quot;, line 30106]:<br>
&nbsp; No default Proper Dih. types<br>ERROR 0 [file &quot;topol.top&quot;, line 30107]:<br>&nbsp; No default Proper Dih. types<br>ERROR 0 [file &quot;topol.top&quot;, line 30146]:<br>&nbsp; No default Proper Dih. types<br>ERROR 0 [file &quot;topol.top&quot;, line 30147]:<br>
&nbsp; No default Proper Dih. types<br>ERROR 0 [file &quot;topol.top&quot;, line 30186]:<br>&nbsp; No default Proper Dih. types<br>ERROR 0 [file &quot;topol.top&quot;, line 30187]:<br>&nbsp; No default Proper Dih. types<br>ERROR 0 [file &quot;topol.top&quot;, line 30226]:<br>
&nbsp; No default Proper Dih. types<br>ERROR 0 [file &quot;topol.top&quot;, line 30227]:<br>&nbsp; No default Proper Dih. types<br>ERROR 0 [file &quot;topol.top&quot;, line 30266]:<br>&nbsp; No default Proper Dih. types<br>ERROR 0 [file &quot;topol.top&quot;, line 30267]:<br>
&nbsp; No default Proper Dih. types<br>ERROR 0 [file &quot;topol.top&quot;, line 30306]:<br>&nbsp; No default Proper Dih. types<br>ERROR 0 [file &quot;topol.top&quot;, line 30307]:<br>&nbsp; No default Proper Dih. types<br>ERROR 0 [file &quot;topol.top&quot;, line 30346]:<br>
&nbsp; No default Proper Dih. types<br>ERROR 0 [file &quot;topol.top&quot;, line 30347]:<br>&nbsp; No default Proper Dih. types<br>ERROR 0 [file &quot;topol.top&quot;, line 30386]:<br>&nbsp; No default Proper Dih. types<br>ERROR 0 [file &quot;topol.top&quot;, line 30387]:<br>
&nbsp; No default Proper Dih. types<br>ERROR 0 [file &quot;topol.top&quot;, line 30426]:<br>&nbsp; No default Proper Dih. types<br>ERROR 0 [file &quot;topol.top&quot;, line 30427]:<br>&nbsp; No default Proper Dih. types<br>ERROR 0 [file &quot;topol.top&quot;, line 30466]:<br>
&nbsp; No default Proper Dih. types<br>ERROR 0 [file &quot;topol.top&quot;, line 30467]:<br>&nbsp; No default Proper Dih. types<br>ERROR 0 [file &quot;topol.top&quot;, line 30506]:<br>&nbsp; No default Proper Dih. types<br>ERROR 0 [file &quot;topol.top&quot;, line 30507]:<br>
&nbsp; No default Proper Dih. types<br>ERROR 0 [file &quot;topol.top&quot;, line 30546]:<br>&nbsp; No default Proper Dih. types<br>ERROR 0 [file &quot;topol.top&quot;, line 30547]:<br>&nbsp; No default Proper Dih. types<br>ERROR 0 [file &quot;topol.top&quot;, line 30586]:<br>
&nbsp; No default Proper Dih. types<br>ERROR 0 [file &quot;topol.top&quot;, line 30587]:<br>&nbsp; No default Proper Dih. types<br>ERROR 0 [file &quot;topol.top&quot;, line 30626]:<br>&nbsp; No default Proper Dih. types<br>ERROR 0 [file &quot;topol.top&quot;, line 30627]:<br>
&nbsp; No default Proper Dih. types<br>ERROR 0 [file &quot;topol.top&quot;, line 30666]:<br>&nbsp; No default Proper Dih. types<br>ERROR 0 [file &quot;topol.top&quot;, line 30667]:<br>&nbsp; No default Proper Dih. types<br>ERROR 0 [file &quot;topol.top&quot;, line 30706]:<br>
&nbsp; No default Proper Dih. types<br>ERROR 0 [file &quot;topol.top&quot;, line 30707]:<br>&nbsp; No default Proper Dih. types<br>ERROR 0 [file &quot;topol.top&quot;, line 30746]:<br>&nbsp; No default Proper Dih. types<br>ERROR 0 [file &quot;topol.top&quot;, line 30747]:<br>
&nbsp; No default Proper Dih. types<br>ERROR 0 [file &quot;topol.top&quot;, line 30786]:<br>&nbsp; No default Proper Dih. types<br>ERROR 0 [file &quot;topol.top&quot;, line 30787]:<br>&nbsp; No default Proper Dih. types<br>ERROR 0 [file &quot;topol.top&quot;, line 30826]:<br>
&nbsp; No default Proper Dih. types<br>ERROR 0 [file &quot;topol.top&quot;, line 30827]:<br>&nbsp; No default Proper Dih. types<br>ERROR 0 [file &quot;topol.top&quot;, line 30866]:<br>&nbsp; No default Proper Dih. types<br>ERROR 0 [file &quot;topol.top&quot;, line 30867]:<br>
&nbsp; No default Proper Dih. types<br>ERROR 0 [file &quot;topol.top&quot;, line 30906]:<br>&nbsp; No default Proper Dih. types<br>ERROR 0 [file &quot;topol.top&quot;, line 30907]:<br>&nbsp; No default Proper Dih. types<br>ERROR 0 [file &quot;topol.top&quot;, line 30946]:<br>
&nbsp; No default Proper Dih. types<br>ERROR 0 [file &quot;topol.top&quot;, line 30947]:<br>&nbsp; No default Proper Dih. types<br>ERROR 0 [file &quot;topol.top&quot;, line 30986]:<br><br><br>Please help me out in this issue.Thanks in advance..<br>
<br>-krithika<br>